Es licenciada en Sociología por la Facultad de Ciencias Políticas y Sociales de la UNAM, así como maestra y doctora en Ciencias Políticas y Sociales por la University of Cambridge, King's College.

Ganadora del King's College Prize, en 1979, María Amparo Casar Pérez es catedrática e investigadora del Departamento de Estudios Políticos del Centro de Investigación y Docencia Económicas, CIDE, de 1979 a la fecha.

También es miembro del Comité Editorial de la Revista NEXOS desde 1995 y, a partir de 2003, pertenece al Comité Editorial del Fondo de Cultura Económica, Sección Política.

Ha sido Coordinadora docente del Departamento de Estudios Políticos del CIDE, Investigadora en el Programa de Estudios de América del Norte del Instituto Latinoamericano de Estudios Transnacionales (ILET), Consultora académica del Programa de Estudios de América del Norte del ILET, Secretaria General del CIDE, Directora de la División de Estudios Políticos, Asesora externa en materia política en la Coordinación de Asesores del Departamento del Distrito Federal, Miembro de la Unidad de Enlace con el Congreso para la negociación presupuestal de 1997 en la Secretaría de Hacienda, Miembro del Sistema Nacional de Investigadores y Coordinadora de Asesores del Secretario de Gobernación de diciembre de 2001 a junio de 2005.